如何用圆二色谱判断蛋白的二级结构

圆二色谱（Circular Dichroism，简称CD）是分析有机化合物光学活性的重要方法之一。在生物化学领域中，CD 被广泛用于研究生物大分子，特别是蛋白质和核酸的结构和性质。蛋白质二级结构的测定是CD研究的一个重要应用。

一、原理

蛋白质的二级结构主要包括α螺旋、β折叠和无规卷曲三种形式，它们在空间中的取向和排列方式不同，对于左旋和右旋圆偏振光的吸收也不同，表现出不同的CD光谱。通过测定蛋白质的CD光谱并进行解析，可以了解蛋白质的二级结构类型及其含量。

二、方法

在测定过程中，首先将蛋白质样品溶解在适当的缓冲液中，然后在一定的温度和波长范围内（通常是190-250nm）测定其CD光谱。测得的原始CD光谱是蛋白质对于圆偏振光的吸收差，与蛋白质的浓度和光程有关，需要进行单位转换，得到每个氨基酸残基的平均消旋度。然后，使用适当的算法（如CONTIN、SELCON3、CDSSTR等）对光谱进行解析，就可以得到蛋白质中各种二级结构的相对含量。

三、注意事项

在使用CD进行蛋白质二级结构分析时，需要注意以下几点：

1.蛋白质样品的纯度要高，以避免杂质对光谱的影响。

2.蛋白质的浓度要适中，过高或过低都会影响测定结果。

3.缓冲液中不应含有能吸收紫外光的成分，如表面活性剂、某些无机盐等。

4.由于CD仪器的测量范围和精度限制，有些蛋白质的二级结构可能无法准确测定。

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